Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI3O43414 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI3O43414 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI3O43414 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI3O43414 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERI3O43414 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERI3O43414 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ERI3O43414 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERI3O43414 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERI3O43414 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI3O43414 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI3O43414 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI3O43414 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI3O43414 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI3O43414 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms