Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DYNC1LI2O43237 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms