Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEFVO15553 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEFVO15553 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEFVO15553 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEFVO15553 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEFVO15553 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEFVO15553 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEFVO15553 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEFVO15553 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEFVO15553 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEFVO15553 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEFVO15553 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEFVO15553 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEFVO15553 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEFVO15553 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEFVO15553 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEFVO15553 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEFVO15553 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEFVO15553 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEFVO15553 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms