Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC2O15247 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC2O15247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC2O15247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms