Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VGFO15240 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VGFO15240 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VGFO15240 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
VGFO15240 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VGFO15240 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VGFO15240 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VGFO15240 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VGFO15240 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VGFO15240 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VGFO15240 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VGFO15240 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VGFO15240 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VGFO15240 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VGFO15240 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VGFO15240 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VGFO15240 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
VGFO15240 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
VGFO15240 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
VGFO15240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
VGFO15240 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
VGFO15240 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms