Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN6O15212 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms