Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1CO15160 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms