Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP2O14595 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP2O14595 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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