Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAFD1O14545 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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