Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRTO14522 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRTO14522 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
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