Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5AO00534 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5AO00534 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms