Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGRNO00468 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGRNO00468 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGRNO00468 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGRNO00468 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGRNO00468 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGRNO00468 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGRNO00468 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGRNO00468 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms