Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFRD1O00458 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFRD1O00458 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms