Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLRMTO00411 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLRMTO00411 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms