Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NFKBIEO00221 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIEO00221 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIEO00221 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIEO00221 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIEO00221 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIEO00221 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIEO00221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIEO00221 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIEO00221 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIEO00221 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NFKBIEO00221 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NFKBIEO00221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms