Protein–RNA interactions for Protein: O00186

STXBP3, Syntaxin-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP3O00186 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STXBP3O00186 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STXBP3O00186 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms