Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01387J3KSC0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms