Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CROCC2H7BZ55 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CROCC2H7BZ55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CROCC2H7BZ55 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms