Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VP50 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VP50 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VP50 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VP50 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
F8VP50 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
F8VP50 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
F8VP50 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VP50 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8VP50 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VP50 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VP50 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms