Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf172C9J069 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms