Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CENPBD1B2RD01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms