Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms