Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms