Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85CA6NKD9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms