Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L4A6NEF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms