Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPN1LA6NDY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms