Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBA1A5PL33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBA1A5PL33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBA1A5PL33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBA1A5PL33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBA1A5PL33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms