Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSDA5PKW4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PSDA5PKW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms