Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMB4A4D0S4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMB4A4D0S4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms