Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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