Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD3A2A2Y4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD3A2A2Y4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms