Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms