Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F8A0AVK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms