Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms