Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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