Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms