Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YVX5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms