Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI54

PRO0628, Putative uncharacterized protein PRO0628, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO0628Q9UI54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRO0628Q9UI54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRO0628Q9UI54 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRO0628Q9UI54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRO0628Q9UI54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRO0628Q9UI54 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms