Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NmuQ9QXK8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NmuQ9QXK8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NmuQ9QXK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NmuQ9QXK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NmuQ9QXK8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NmuQ9QXK8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NmuQ9QXK8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NmuQ9QXK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NmuQ9QXK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NmuQ9QXK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NmuQ9QXK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmuQ9QXK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmuQ9QXK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NmuQ9QXK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NmuQ9QXK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NmuQ9QXK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms