Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NmuQ9QXK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NmuQ9QXK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NmuQ9QXK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NmuQ9QXK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NmuQ9QXK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NmuQ9QXK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NmuQ9QXK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NmuQ9QXK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NmuQ9QXK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NmuQ9QXK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NmuQ9QXK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NmuQ9QXK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NmuQ9QXK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NmuQ9QXK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NmuQ9QXK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NmuQ9QXK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NmuQ9QXK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NmuQ9QXK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NmuQ9QXK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NmuQ9QXK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NmuQ9QXK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NmuQ9QXK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NmuQ9QXK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NmuQ9QXK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NmuQ9QXK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NmuQ9QXK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NmuQ9QXK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NmuQ9QXK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NmuQ9QXK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NmuQ9QXK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NmuQ9QXK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NmuQ9QXK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NmuQ9QXK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NmuQ9QXK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NmuQ9QXK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NmuQ9QXK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NmuQ9QXK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmuQ9QXK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmuQ9QXK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NmuQ9QXK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NmuQ9QXK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NmuQ9QXK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NmuQ9QXK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NmuQ9QXK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmuQ9QXK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmuQ9QXK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmuQ9QXK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmuQ9QXK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmuQ9QXK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmuQ9QXK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmuQ9QXK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NmuQ9QXK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NmuQ9QXK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NmuQ9QXK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NmuQ9QXK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NmuQ9QXK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NmuQ9QXK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NmuQ9QXK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NmuQ9QXK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NmuQ9QXK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NmuQ9QXK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NmuQ9QXK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NmuQ9QXK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmuQ9QXK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmuQ9QXK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NmuQ9QXK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmuQ9QXK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmuQ9QXK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmuQ9QXK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmuQ9QXK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmuQ9QXK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmuQ9QXK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NmuQ9QXK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NmuQ9QXK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NmuQ9QXK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NmuQ9QXK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NmuQ9QXK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NmuQ9QXK8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NmuQ9QXK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NmuQ9QXK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NmuQ9QXK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NmuQ9QXK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NmuQ9QXK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NmuQ9QXK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NmuQ9QXK8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NmuQ9QXK8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NmuQ9QXK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NmuQ9QXK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NmuQ9QXK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NmuQ9QXK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NmuQ9QXK8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NmuQ9QXK8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NmuQ9QXK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NmuQ9QXK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NmuQ9QXK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NmuQ9QXK8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NmuQ9QXK8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NmuQ9QXK8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NmuQ9QXK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms