Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR30

DDX21, Nucleolar RNA helicase 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX21Q9NR30 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 514.72□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 212.19□□□□□ -0.466e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.516e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.976e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-205ENST00000463586 3771 ntTSL 27.65□□□□□ -1.196e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.196e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.134e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 56.96□□□□□ -1.34e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)6.11□□□□□ -1.434e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.664e-13■■■■■ 40.1
DDX21Q9NR30 MST1R-212ENST00000497001 1488 ntTSL 1 (best)22.59■■□□□ 1.214e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.174e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-209ENST00000485044 1944 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.964e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-211ENST00000493535 1626 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-208ENST00000468525 2727 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-213ENST00000612032 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-203ENST00000411578 4683 ntTSL 513.82□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 TMF1-203ENST00000488010 3399 ntTSL 511.68□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 37.3
DDX21Q9NR30 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 222.65■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 519.7■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 219.08■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 216.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 412.47□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 210.25□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 35.5
DDX21Q9NR30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.923e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 224.82■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 323.9■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 321.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 219.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 218.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 SND1-210ENST00000483503 603 ntTSL 514.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 SND1-215ENST00000492772 549 ntTSL 414.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 SND1-202ENST00000461056 555 ntTSL 410.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 SND1-207ENST00000468621 494 ntTSL 46.86□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 34.3
DDX21Q9NR30 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 533.45■■■□□ 2.952e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.872e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.342e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 227.43■■□□□ 1.982e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 417.96■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 26.98□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 34.1
DDX21Q9NR30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.835e-7■■■■■ 33
DDX21Q9NR30 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 33
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DDX21Q9NR30 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 33
DDX21Q9NR30 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 31.4
DDX21Q9NR30 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 31.4
DDX21Q9NR30 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 47.14□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 31.4
DDX21Q9NR30 IKBKB-228ENST00000523517 2378 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-205ENST00000517812 523 ntTSL 321.3■■□□□ 11e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-206ENST00000517890 2501 ntTSL 219.95■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-211ENST00000519733 527 ntTSL 418.46■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-207ENST00000517917 1731 ntTSL 218.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-209ENST00000518679 2784 ntTSL 217.77■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-203ENST00000517388 577 ntTSL 417.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-208ENST00000518647 1543 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-215ENST00000520320 628 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 NAA38-202ENST00000570555 783 ntTSL 515.96■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-227ENST00000523105 1966 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-220ENST00000521661 2196 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-214ENST00000520201 5002 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-201ENST00000342222 3952 ntTSL 214.24□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-216ENST00000520655 3777 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 31
DDX21Q9NR30 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 30.9
DDX21Q9NR30 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 30.9
DDX21Q9NR30 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 30.9
DDX21Q9NR30 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 30.9
DDX21Q9NR30 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.686e-8■■■■■ 29.3
DDX21Q9NR30 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 513.41□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 29.3
DDX21Q9NR30 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 511.52□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 29.3
DDX21Q9NR30 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.254e-10■■■■■ 29
DDX21Q9NR30 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.64e-10■■■■■ 29
DDX21Q9NR30 MAP2K2-210ENST00000601786 1778 ntTSL 223.8■■□□□ 1.44e-10■■■■■ 29
DDX21Q9NR30 MAP2K2-204ENST00000595715 861 ntTSL 523.08■■□□□ 1.294e-10■■■■■ 29
DDX21Q9NR30 MAP2K2-209ENST00000600584 2926 ntTSL 217.46■□□□□ 0.394e-10■■■■■ 29
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