Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rcan1Q9JHG6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rcan1Q9JHG6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rcan1Q9JHG6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rcan1Q9JHG6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rcan1Q9JHG6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rcan1Q9JHG6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rcan1Q9JHG6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Rcan1Q9JHG6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rcan1Q9JHG6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rcan1Q9JHG6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rcan1Q9JHG6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rcan1Q9JHG6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rcan1Q9JHG6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rcan1Q9JHG6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rcan1Q9JHG6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rcan1Q9JHG6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rcan1Q9JHG6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rcan1Q9JHG6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rcan1Q9JHG6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rcan1Q9JHG6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rcan1Q9JHG6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rcan1Q9JHG6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rcan1Q9JHG6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rcan1Q9JHG6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rcan1Q9JHG6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rcan1Q9JHG6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rcan1Q9JHG6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rcan1Q9JHG6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rcan1Q9JHG6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rcan1Q9JHG6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rcan1Q9JHG6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rcan1Q9JHG6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rcan1Q9JHG6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rcan1Q9JHG6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms