Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 BRAT1-204ENST00000469750 5226 ntTSL 216■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 64.9
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XRN2Q9H0D6 BRAT1-205ENST00000473879 666 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 64.9
XRN2Q9H0D6 BANP-224ENST00000565242 801 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 64.9
XRN2Q9H0D6 ARID3A-207ENST00000592216 564 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 64.9
XRN2Q9H0D6 BRAT1-203ENST00000467558 4440 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 64.9
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XRN2Q9H0D6 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 63.3
XRN2Q9H0D6 EIF3I-201ENST00000355082 564 ntTSL 318.15■□□□□ 0.53e-21■■■■■ 63.1
XRN2Q9H0D6 EIF3I-205ENST00000483517 744 ntTSL 516.08■□□□□ 0.163e-21■■■■■ 63.1
XRN2Q9H0D6 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-21■■■■■ 63.1
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XRN2Q9H0D6 EIF3I-206ENST00000489353 527 ntTSL 312.4□□□□□ -0.423e-21■■■■■ 63.1
XRN2Q9H0D6 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 415.92■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 62.6
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XRN2Q9H0D6 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 29.21□□□□□ -0.941e-14■■■■■ 62.2
XRN2Q9H0D6 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.951e-14■■■■■ 62.2
XRN2Q9H0D6 BMI1-205ENST00000456675 550 ntTSL 25.54□□□□□ -1.521e-14■■■■■ 62.2
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XRN2Q9H0D6 COMMD3-BMI1-202ENST00000463409 605 ntTSL 35.11□□□□□ -1.591e-14■■■■■ 62.2
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XRN2Q9H0D6 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-12■■■■■ 62
XRN2Q9H0D6 TMEM138-212ENST00000545420 555 ntTSL 35.53□□□□□ -1.522e-12■■■■■ 62
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XRN2Q9H0D6 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 326.08■■□□□ 1.778e-11■■■■■ 61.3
XRN2Q9H0D6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.418e-11■■■■■ 61.3
XRN2Q9H0D6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.238e-11■■■■■ 61.3
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XRN2Q9H0D6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 61.3
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XRN2Q9H0D6 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.438e-11■■■■■ 61.3
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XRN2Q9H0D6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 59.5
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XRN2Q9H0D6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.363e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-227ENST00000634390 492 ntTSL 416.84■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-209ENST00000419567 643 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-213ENST00000465382 811 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 RPL3-210ENST00000464182 616 ntTSL 216.38■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-219ENST00000474053 728 ntTSL 516.14■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-229ENST00000634522 545 ntTSL 516.04■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 DAGLA-202ENST00000540717 5699 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.073e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 TONSL-202ENST00000497613 6607 ntTSL 215.36■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-204ENST00000376357 567 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-216ENST00000471338 699 ntTSL 514.54□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-203ENST00000367375 996 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WWP2-218ENST00000569620 738 ntTSL 514.17□□□□□ -0.143e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WDR45-210ENST00000423215 816 ntTSL 513.77□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 57.7
XRN2Q9H0D6 WWP2-219ENST00000569658 583 ntTSL 213.61□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 57.7
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