Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shisa5Q9D7I0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shisa5Q9D7I0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shisa5Q9D7I0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shisa5Q9D7I0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shisa5Q9D7I0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shisa5Q9D7I0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shisa5Q9D7I0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shisa5Q9D7I0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shisa5Q9D7I0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shisa5Q9D7I0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shisa5Q9D7I0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shisa5Q9D7I0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shisa5Q9D7I0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shisa5Q9D7I0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shisa5Q9D7I0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shisa5Q9D7I0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisa5Q9D7I0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisa5Q9D7I0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shisa5Q9D7I0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa5Q9D7I0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shisa5Q9D7I0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shisa5Q9D7I0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shisa5Q9D7I0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shisa5Q9D7I0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa5Q9D7I0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms