RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032109.4

Ino80b-201, Transcript of INO80 complex subunit B, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ino80b, Length 1,038 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa61,76■■■■■ 7,48
Ino80b-201ENSMUST00000032109 NischQ80TM9 1593 aa60,55■■■■■ 7,28
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Abcc8B2RUS7 1588 aa58,84■■■■■ 7,01
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Abcc9P70170 1546 aa58,72■■■■■ 6,99
Ino80b-201ENSMUST00000032109 ScribQ80U72 1612 aa57,43■■■■■ 6,78
Ino80b-201ENSMUST00000032109 NacadQ5SWP3 1504 aa55,34■■■■■ 6,45
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Kdm5dQ62240 1548 aa55,25■■■■■ 6,43
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Sycp2Q9CUU3 1500 aa54,34■■■■■ 6,29
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa53,95■■■■■ 6,23
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Dcaf1Q80TR8 1506 aa53,85■■■■■ 6,21
Ino80b-201ENSMUST00000032109 BicraF8VPZ9 1578 aa53,83■■■■■ 6,21
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa52,72■■■■■ 6,03
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP52,44■■■■■ 5,99
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP52,4■■■■■ 5,98
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Baz1aO88379 1555 aa51,84■■■■■ 5,89
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP51,72■■■■■ 5,87
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Crybg2B7ZCC2 1516 aa51,67■■■■■ 5,86
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa51,58■■■■■ 5,85
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ccdc180J3QNE4 1664 aa51,57■■■■■ 5,85
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rhox8Q6VSS7 320 aa51,37■■■■■ 5,81
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP51,34■■■■■ 5,81
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ercc6F8VPZ5 1481 aa51,3■■■■■ 5,8
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Smarca2Q6DIC0 1577 aa51,07■■■■■ 5,77
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Fam135aQ6NS59 1506 aa51,01■■■■■ 5,76
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP50,95■■■■■ 5,75
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa50,84■■■■■ 5,73
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa50,6■■■■■ 5,69
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Wdr62Q3U3T8 1523 aa50,56■■■■■ 5,68
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Frmpd1A2AKB4 1549 aa50,5■■■■■ 5,67
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP50,39■■■■■ 5,66
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Baz1bQ9Z277 1479 aa50,17■■■■■ 5,62
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ubl4bQ9CQ84 188 aa50,02■■■■■ 5,6
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Unc13aQ4KUS2 1712 aa49,87■■■■■ 5,57
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Mrc2Q64449 1479 aa49,81■■■■■ 5,56
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Dnajc5P60904 198 aa49,68■■■■■ 5,54
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Trim41Q5NCC3 630 aa49,43■■■■■ 5,5
Ino80b-201ENSMUST00000032109 CftrP26361 1476 aa49,18■■■■■ 5,46
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa49,14■■■■■ 5,46
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Synj1Q8CHC4 1574 aa49,03■■■■■ 5,44
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa48,88■■■■■ 5,41
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rtl1Q7M732 1744 aa48,86■■■■■ 5,41
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP48,69■■■■■ 5,39
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP48,56■■■■■ 5,36
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cux2P70298 1426 aa48,55■■■■■ 5,36
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Kif21aQ9QXL2 1672 aa48,48■■■■■ 5,35
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Kif15Q6P9L6 1387 aa48,37■■■■■ 5,33
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa48,31■■■■■ 5,32
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP48,25■■■■■ 5,31
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP48,11■■■■■ 5,29
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Shroom2A2ALU4 1481 aa48,05■■■■■ 5,28
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Lamc3Q9R0B6 1581 aa47,96■■■■■ 5,27
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP47,92■■■■■ 5,26
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cep164Q5DU05 1446 aa47,68■■■■■ 5,22
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP47,65■■■■■ 5,22
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Col17a1Q07563 1470 aa47,65■■■■■ 5,22
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Plb1Q3TTY0 1478 aa47,53■■■■■ 5,2
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP47,46■■■■■ 5,19
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP47,39■■■■■ 5,18
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Top2bQ64511 1612 aa47,36■■■■■ 5,17
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Il27Q8K3I6 234 aa47,31■■■■■ 5,16
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Crocc2F6XLV1 1638 aa47,22■■■■■ 5,15
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ccdc18Q640L5 1455 aa47,21■■■■■ 5,15
Ino80b-201ENSMUST00000032109 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP47,17■■■■■ 5,14
Ino80b-201ENSMUST00000032109 TnnQ80Z71 1560 aa47,14■■■■■ 5,14
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP47,09■■■■■ 5,13
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rusc2Q80U22 1514 aa47,06■■■■■ 5,12
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Camsap1A2AHC3 1581 aa47,03■■■■■ 5,12
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ift140E9PY46 1464 aa46,96■■■■■ 5,11
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP46,83■■■■■ 5,09
Ino80b-201ENSMUST00000032109 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP46,82■■■■■ 5,09
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Golga3P55937 1487 aa46,67■■■■■ 5,06
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Duox2A2AQ99 1517 aa46,59■■■■■ 5,05
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cngb1E1AZ71 1325 aa46,58■■■■■ 5,05
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Disp1Q3TDN0 1521 aa46,54■■■■■ 5,04
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Setd1bQ8CFT2 1985 aa46,44■■■■■ 5,03
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa46,38■■■■■ 5,02
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP46,33■■■■■ 5,01
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Fmn1Q05860 1466 aa46,32■■■■■ 5,01
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Samd9lQ69Z37 1561 aa46,3■■■■■ 5
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Grin2bQ01097 1482 aa46,27■■■■■ 5
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Adgrl3Q80TS3 1537 aa46,27■■■■■ 5
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa46,27■■■■■ 5
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP46,25■■■■■ 4,99
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa46,21■■■■■ 4,99
Ino80b-201ENSMUST00000032109 PtprkP35822 1457 aa46,1■■■■■ 4,97
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa46,08■■■■■ 4,97
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Cep170Q6A065 1588 aa46,08■■■■■ 4,97
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa46■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Rad54l2Q99NG0 1466 aa46■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Gm156Q58A37 223 aa45,97■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Fgd6Q69ZL1 1399 aa45,96■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Efcab5A0JP43 1406 aa45,94■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP45,94■■■■■ 4,95
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Grin2aP35436 1464 aa45,9■■■■■ 4,94
Ino80b-201ENSMUST00000032109 PtprtQ99M80 1454 aa45,89■■■■■ 4,94
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Magi3Q9EQJ9 1476 aa45,87■■■■■ 4,93
Ino80b-201ENSMUST00000032109 AknaQ80VW7 1404 aa45,7■■■■■ 4,91
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Abcc1O35379 1528 aa45,66■■■■■ 4,9
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Pprc1Q6NZN1 1644 aa45,57■■■■■ 4,89
Ino80b-201ENSMUST00000032109 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP45,54■■■■■ 4,88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,6 ms