Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mis18aQ9CZJ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mis18aQ9CZJ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mis18aQ9CZJ6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mis18aQ9CZJ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mis18aQ9CZJ6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mis18aQ9CZJ6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mis18aQ9CZJ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Mis18aQ9CZJ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mis18aQ9CZJ6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mis18aQ9CZJ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Mis18aQ9CZJ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mis18aQ9CZJ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mis18aQ9CZJ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mis18aQ9CZJ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mis18aQ9CZJ6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mis18aQ9CZJ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mis18aQ9CZJ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mis18aQ9CZJ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mis18aQ9CZJ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mis18aQ9CZJ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mis18aQ9CZJ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mis18aQ9CZJ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mis18aQ9CZJ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mis18aQ9CZJ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms