Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIGMAR1Q99720 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIGMAR1Q99720 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIGMAR1Q99720 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIGMAR1Q99720 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIGMAR1Q99720 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIGMAR1Q99720 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIGMAR1Q99720 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIGMAR1Q99720 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIGMAR1Q99720 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIGMAR1Q99720 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms