Protein–RNA interactions for Protein: Q92331

VPS5, Vacuolar protein sorting-associated protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS5Q92331 LYS4YDR234W 2082 nt11.45□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 YFL067WYFL067W 528 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 AHT1YHR093W 549 nt11.43□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 WSC2YNL283C 1512 nt11.43□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 DDR2YOL052C-A 186 nt11.42□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 MCH5YOR306C 1566 nt11.41□□□□□ -0.58
VPS5Q92331 TAD3YLR316C 969 nt11.39□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 YJL225CYJL225C 5277 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 STB1YNL309W 1263 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 HEM12YDR047W 1089 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 SPC25YER018C 666 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 FRE6YLL051C 2139 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS5Q92331 SNG1YGR197C 1644 nt11.33□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 GPI16YHR188C 1833 nt11.32□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 MIC10YCL057C-A 294 nt11.31□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 CCT4YDL143W 1587 nt11.3□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 YFL054CYFL054C 1941 nt11.29□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 ANP1YEL036C 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
VPS5Q92331 FEN2YCR028C 1539 nt11.26□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 YDR094WYDR094W 336 nt11.26□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 VPS60YDR486C 690 nt11.25□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 UBX6YJL048C 1191 nt11.25□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 SWC5YBR231C 912 nt11.25□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 BOR1YNL275W 1731 nt11.23□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.22□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 BDH1YAL060W 1149 nt11.21□□□□□ -0.61
VPS5Q92331 ALG3YBL082C 1377 nt11.19□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 YLR415CYLR415C 339 nt11.19□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 YFR018CYFR018C 1092 nt11.16□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 YIR016WYIR016W 798 nt11.16□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 SPT8YLR055C 1809 nt11.16□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 RAX1YOR301W 1308 nt11.15□□□□□ -0.62
VPS5Q92331 BNA2YJR078W 1362 nt11.15□□□□□ -0.63
VPS5Q92331 YSP3YOR003W 1437 nt11.13□□□□□ -0.63
VPS5Q92331 PEX25YPL112C 1185 nt11.11□□□□□ -0.63
VPS5Q92331 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.1□□□□□ -0.63
VPS5Q92331 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.1□□□□□ -0.63
VPS5Q92331 YNL115CYNL115C 1935 nt11.08□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 YFL066CYFL066C 1179 nt11.07□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 MIC12YBR262C 321 nt11.07□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 PRE6YOL038W 765 nt11.06□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 RRT5YFR032C 870 nt11.05□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 SWE1YJL187C 2460 nt11.03□□□□□ -0.64
VPS5Q92331 PAU16YKL224C 372 nt11□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 HHO1YPL127C 777 nt11□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 XDJ1YLR090W 1380 nt10.98□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 TIM17YJL143W 477 nt10.97□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 CCA1YER168C 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 YGR201CYGR201C 678 nt10.96□□□□□ -0.65
VPS5Q92331 VPS75YNL246W 795 nt10.95□□□□□ -0.66
VPS5Q92331 SHM2YLR058C 1410 nt10.93□□□□□ -0.66
VPS5Q92331 GDH3YAL062W 1374 nt10.92□□□□□ -0.66
VPS5Q92331 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.89□□□□□ -0.67
VPS5Q92331 AGP1YCL025C 1902 nt10.86□□□□□ -0.67
VPS5Q92331 ALG12YNR030W 1656 nt10.85□□□□□ -0.67
VPS5Q92331 AVT6YER119C 1347 nt10.84□□□□□ -0.67
VPS5Q92331 SSN3YPL042C 1668 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 PAU7YAR020C 168 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 GOR1YNL274C 1053 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 NIT1YIL164C 600 nt10.81□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 SGT2YOR007C 1041 nt10.81□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 GLK1YCL040W 1503 nt10.8□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 MIR1YJR077C 936 nt10.79□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 NAT4YMR069W 858 nt10.79□□□□□ -0.68
VPS5Q92331 DUS1YML080W 1272 nt10.77□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 DUT1YBR252W 444 nt10.77□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 HSL7YBR133C 2484 nt10.75□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 THI74YDR438W 1113 nt10.74□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 DAT1YML113W 747 nt10.74□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 BSP1YPR171W 1731 nt10.72□□□□□ -0.69
VPS5Q92331 MSF1YPR047W 1410 nt10.7□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 SHB17YKR043C 816 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 YCR102CYCR102C 1107 nt10.68□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 FUR4YBR021W 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 YCL074WYCL074W 927 nt10.67□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 UBA4YHR111W 1323 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS5Q92331 GID7YCL039W 2238 nt10.65□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 YDR010CYDR010C 333 nt10.64□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 STR3YGL184C 1398 nt10.64□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 AQY2YLL052C 450 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 YSR3YKR053C 1215 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS5Q92331 RET2YFR051C 1641 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 NPP1YCR026C 2229 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 HEL2YDR266C 1920 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 SFP1YLR403W 2052 nt10.57□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 YGL034CYGL034C 366 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 NBP35YGL091C 987 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 PHO89YBR296C 1725 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 YAT1YAR035W 2064 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 HSP60YLR259C 1719 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS5Q92331 YCR087WYCR087W 516 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS5Q92331 XYL2YLR070C 1071 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS5Q92331 MET2YNL277W 1461 nt10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms