Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Apol7cQ8C6E1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Apol7cQ8C6E1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Apol7cQ8C6E1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Apol7cQ8C6E1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Apol7cQ8C6E1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Apol7cQ8C6E1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Apol7cQ8C6E1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Apol7cQ8C6E1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Apol7cQ8C6E1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Apol7cQ8C6E1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Apol7cQ8C6E1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Apol7cQ8C6E1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Apol7cQ8C6E1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Apol7cQ8C6E1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Apol7cQ8C6E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Apol7cQ8C6E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Apol7cQ8C6E1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Apol7cQ8C6E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Apol7cQ8C6E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Apol7cQ8C6E1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Apol7cQ8C6E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Apol7cQ8C6E1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apol7cQ8C6E1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Apol7cQ8C6E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Apol7cQ8C6E1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Apol7cQ8C6E1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Apol7cQ8C6E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Apol7cQ8C6E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Apol7cQ8C6E1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Apol7cQ8C6E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Apol7cQ8C6E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms