RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173348.1

Nkx1-1-201, Transcript of NK1 homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nkx1-1, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa62,34■■■■■ 7,57
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 NischQ80TM9 1593 aa61,33■■■■■ 7,41
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Abcc8B2RUS7 1588 aa59,32■■■■■ 7,09
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Abcc9P70170 1546 aa59,32■■■■■ 7,09
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 ScribQ80U72 1612 aa57,45■■■■■ 6,79
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 NacadQ5SWP3 1504 aa55,55■■■■■ 6,48
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Kdm5dQ62240 1548 aa55,46■■■■■ 6,47
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Dcaf1Q80TR8 1506 aa54,5■■■■■ 6,32
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Sycp2Q9CUU3 1500 aa54,45■■■■■ 6,31
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 BicraF8VPZ9 1578 aa53,78■■■■■ 6,2
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa53,5■■■■■ 6,16
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ccdc180J3QNE4 1664 aa52,72■■■■■ 6,03
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rhox8Q6VSS7 320 aa52,71■■■■■ 6,03
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Baz1aO88379 1555 aa52,68■■■■■ 6,02
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa52,56■■■■■ 6
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Crybg2B7ZCC2 1516 aa52,41■■■■■ 5,98
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP52,31■■■■■ 5,96
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP52,04■■■■■ 5,92
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP51,94■■■■■ 5,91
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP51,74■■■■■ 5,87
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP51,3■■■■■ 5,8
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ercc6F8VPZ5 1481 aa51,29■■■■■ 5,8
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa51,22■■■■■ 5,79
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Smarca2Q6DIC0 1577 aa51,19■■■■■ 5,79
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa51,06■■■■■ 5,77
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa50,97■■■■■ 5,75
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Fam135aQ6NS59 1506 aa50,78■■■■■ 5,72
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Wdr62Q3U3T8 1523 aa50,64■■■■■ 5,7
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Frmpd1A2AKB4 1549 aa50,52■■■■■ 5,68
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rtl1Q7M732 1744 aa50,35■■■■■ 5,65
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP50,29■■■■■ 5,64
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Baz1bQ9Z277 1479 aa50,16■■■■■ 5,62
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Unc13aQ4KUS2 1712 aa50,05■■■■■ 5,6
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa49,89■■■■■ 5,58
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ubl4bQ9CQ84 188 aa49,83■■■■■ 5,57
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 CftrP26361 1476 aa49,78■■■■■ 5,56
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Synj1Q8CHC4 1574 aa49,72■■■■■ 5,55
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP49,6■■■■■ 5,53
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Mrc2Q64449 1479 aa49,59■■■■■ 5,53
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa49,34■■■■■ 5,49
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP48,93■■■■■ 5,42
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP48,72■■■■■ 5,39
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cux2P70298 1426 aa48,66■■■■■ 5,38
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Kif15Q6P9L6 1387 aa48,64■■■■■ 5,38
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa48,64■■■■■ 5,38
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Trim41Q5NCC3 630 aa48,56■■■■■ 5,36
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Kif21aQ9QXL2 1672 aa48,5■■■■■ 5,36
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Lamc3Q9R0B6 1581 aa48,45■■■■■ 5,35
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP48,13■■■■■ 5,3
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cep164Q5DU05 1446 aa47,98■■■■■ 5,27
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP47,93■■■■■ 5,26
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Dnajc5P60904 198 aa47,87■■■■■ 5,25
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 TnnQ80Z71 1560 aa47,85■■■■■ 5,25
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Top2bQ64511 1612 aa47,83■■■■■ 5,25
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Golga3P55937 1487 aa47,75■■■■■ 5,23
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ccdc18Q640L5 1455 aa47,75■■■■■ 5,23
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Il27Q8K3I6 234 aa47,63■■■■■ 5,22
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP47,62■■■■■ 5,21
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP47,61■■■■■ 5,21
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cngb1E1AZ71 1325 aa47,59■■■■■ 5,21
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Camsap1A2AHC3 1581 aa47,58■■■■■ 5,21
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Crocc2F6XLV1 1638 aa47,51■■■■■ 5,2
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Plb1Q3TTY0 1478 aa47,5■■■■■ 5,19
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP47,47■■■■■ 5,19
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Shroom2A2ALU4 1481 aa47,38■■■■■ 5,17
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Fmn1Q05860 1466 aa47,3■■■■■ 5,16
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP47,18■■■■■ 5,14
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ift140E9PY46 1464 aa47,11■■■■■ 5,13
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rusc2Q80U22 1514 aa47,05■■■■■ 5,12
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Duox2A2AQ99 1517 aa46,97■■■■■ 5,11
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Grin2bQ01097 1482 aa46,85■■■■■ 5,09
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP46,83■■■■■ 5,09
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Col17a1Q07563 1470 aa46,74■■■■■ 5,07
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Setd1bQ8CFT2 1985 aa46,72■■■■■ 5,07
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP46,68■■■■■ 5,06
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Disp1Q3TDN0 1521 aa46,68■■■■■ 5,06
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Samd9lQ69Z37 1561 aa46,68■■■■■ 5,06
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP46,59■■■■■ 5,05
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Efcab5A0JP43 1406 aa46,52■■■■■ 5,04
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP46,49■■■■■ 5,03
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa46,45■■■■■ 5,03
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa46,38■■■■■ 5,01
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP46,34■■■■■ 5,01
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP46,33■■■■■ 5,01
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Rad54l2Q99NG0 1466 aa46,3■■■■■ 5
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 NrkQ9R0G8 1455 aa46,25■■■■■ 4,99
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Grin2aP35436 1464 aa46,23■■■■■ 4,99
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Magi3Q9EQJ9 1476 aa46,19■■■■■ 4,99
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP46,16■■■■■ 4,98
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Shroom4Q1W617 1475 aa46,06■■■■■ 4,96
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Fgd6Q69ZL1 1399 aa45,99■■■■■ 4,95
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 PtprkP35822 1457 aa45,95■■■■■ 4,95
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Chic1Q8CBW7 227 aa45,95■■■■■ 4,95
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 SynmQ70IV5 1561 aa45,95■■■■■ 4,95
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Gpatch8A2A6A1 1505 aa45,93■■■■■ 4,94
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Pla2r1Q62028 1487 aa45,9■■■■■ 4,94
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Cep170Q6A065 1588 aa45,8■■■■■ 4,92
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Adgrl3Q80TS3 1537 aa45,79■■■■■ 4,92
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa45,75■■■■■ 4,91
Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 AknaQ80VW7 1404 aa45,74■■■■■ 4,91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,1 ms